Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPIAP49247 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPIAP49247 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms