Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXNP49023 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PXNP49023 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PXNP49023 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms