Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD8P48556 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms