Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms