Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms