Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms