Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTKP29376 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTKP29376 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTKP29376 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTKP29376 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTKP29376 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms