Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLDCP23378 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLDCP23378 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLDCP23378 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms