Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL9A1P20849 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms