Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms