Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PDE6GP18545 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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