Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAV1P15498 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms