Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNAP12004 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNAP12004 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNAP12004 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNAP12004 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNAP12004 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNAP12004 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNAP12004 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNAP12004 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms