Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF888P0CJ79 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms