Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms