Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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