Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms