Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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