Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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MTSS1O43312 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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MTSS1O43312 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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MTSS1O43312 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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