Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms