Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNMO15061 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNMO15061 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms