Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms