Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
B4DXG7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
B4DXG7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
B4DXG7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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