Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms