Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CCL27Q9Y4X3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CCL27Q9Y4X3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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