Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms