Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms