Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS5Q9UPZ3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HPS5Q9UPZ3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms