Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms