Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms