Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLXNA1Q9UIW2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms