Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms