Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNA3Q9UI47 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms