Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms