Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms