Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms