Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms