Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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