Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG3Q9NT62 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms