Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX15Q9NRS6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX15Q9NRS6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX15Q9NRS6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX15Q9NRS6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX15Q9NRS6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX15Q9NRS6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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