Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms