Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHST12Q9NRB3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms