Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PFDN4Q9NQP4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PFDN4Q9NQP4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PFDN4Q9NQP4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PFDN4Q9NQP4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PFDN4Q9NQP4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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