Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms