Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A20Q9NP91 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A20Q9NP91 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A20Q9NP91 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A20Q9NP91 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A20Q9NP91 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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