Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB9BQ9NP90 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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