Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB18Q9NP72 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms