Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms