Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms