Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms